西元2099年，人类社会达到空前繁荣，为了维护世界和平与繁荣，各国签订和平协议，开始大规模实施军备消减计划。但是谁都没有想到，一场前所未有的灾难即将袭来。
愚人节，一群号称圣殿骑士团的人突然在电视上宣布圣战开始，但无人相信。十分钟后，圣殿骑士团在全球范围类发动了毁灭的核战，各大城市相继沦陷，人类溃不成军......
几近绝望之际，圣殿骑士团的两位首领倒戈，成立了正义之剑兄弟会，与人类一起对抗邪恶势力，并取得节节胜利，圣殿骑士团一号头目迫于形势，仓皇逃走。
在追讨圣殿骑士团残余势力时，人们以外抢得一份密函——埃德萨洞窟文件!文件揭露一个惊人的秘密——原来这场战争是贪欲之神马蒙的阴谋!马蒙利用圣殿骑士团一号头目发动了这场战争，目的在于通过无数生命之间的暴力冲突达到优胜劣汰，从而筛选出完美的生命体，并将它们变成马蒙的第四军团，这个军团包括4大势力：发挥人体极限力量的圣殿骑士团《经过这场战争，马蒙的圣殿骑士团几乎已消灭殆尽，目前仅剩下正义之剑兄弟会，职业为战士》、以气功为主要制衡手法的黑龙会少女堂《武道家》。通过念力支配物质和时空的缪里斯的女儿《法师》，以及机械与人体结合的机器人军团《神枪手》。
马蒙的阴谋还在继续，他的黑恶势力仍未彻底消除，为了避免大规模战争的再次发生，人类秘密启动了“普罗米修斯计划”——正义之剑兄弟会《战士》成功联合其余三大势力《武道家、法师、神枪手》，一同登上宇宙穿梭机，抵达已被马蒙势力占领的宇宙空间站苏拉，开始了拯救地球的正义之战。
西元2182年，人类历史上最悲壮的战争——NX战争一触即发......
