序章
伏羲游历天下，遍观天下山川，万物，部落，风俗。伏羲合聚龙人五部，建立了大一统的龙人国家。图河龙马献图，伏羲在八卦台造八卦，体会出天地万物五行八卦相生相克的秘密。伏羲制定五龙分治的格局，规定五龙部合议制度，是为前五帝。
第一章
五龙首次聚会，各展所长。青龙族贡献海产，白龙部贡献工艺，黄龙部贡献山木，黑龙部贡献河鲜，而赤龙首领神农氏首尝百草，贡献了麦稻和药草，使得更多人得到了生存保障，其才能和品德受到了伏羲的肯定。
黑龙族兴修水利，使稻谷能够种植，各种农作物和药草得到大规模的种植，五龙部人丁开始兴盛。五龙相互交流，各倾所能，在昆仑山下建造龙人之城帝丘，守护登天之路。
神农氏之族子赤熛怒带族人私自登上天梯，与羽人发生感情，惹怒西王母，断绝昆仑之路，部分羽人被逐到日升火山，自称黜人日魅。
白龙族修建了空中之都——百工天都，并且协助青帝修建了鲸驮宫，两族关系亲密，开始互通婚姻。
游牧蛮族兴起，与青龙的商人相遇，两国开始互市。蛮族首领老单于和青帝结为兄弟，互为婚约。
老单于偕小单于拜见了伏羲，并且贡献了骏马，毛皮，牧畜，伏羲将他划归于青龙部。单于对于白龙族人的工艺和美貌生出觊觎之心，小单于在酒宴提出以马匹和奴隶向白龙族换取工匠和美女，遭到拒绝，大怒。由此不协。
伏羲年老归隐，号：天皇太昊。他继续游历天下，按五龙合议制度，指定神农氏为继承人。神农氏继承帝位，其族子赤熛怒聪明过人，博学多才，通晓农艺，虽有过错，脾气急，仍被推举为赤龙族首领，成为新一代的赤帝
黑龙氏受到地下黄泉的蛊惑，认为万物无水不生，自己费力修建河堤，而使神农氏得到大位，由是不服，开始曲解伏羲的八卦，认为伏羲意在传位给自己。遭到白龙，黄龙和青龙的反对
神农氏为安抚黑帝，任命其为天下水官，并且留镇帝丘。黑帝暗中勾结黄泉九黎和鬼方，积蓄实力，排挤白龙，黄龙，青龙，神农氏年老，醉心农艺而不察。赤帝暗中提防
老单于年老不能治国，欲立幼子，为小单于所杀，小单于继位，乃告乱于青帝，青帝以其妻女故，不问。
黑龙氏趁青帝，白帝回到领国的时候，发动叛乱，攻打帝丘之都和龙人禁地。鬼方也袭击了在白龙部在塞外的聚落，屠杀掳掠其族人财富，鬼方与白龙从此成为死敌。赤帝率领族人赶到帝丘，救出神农氏，逃到盘龙城。但是龙人禁地和祖龙陵寝都遭到破坏，圣物母石被抢走，杀戮惨烈，尸横遍野。悲愤不已的神农氏立命四龙合击黑帝。青龙水师入图河截其归路，黑龙族与水战大败，仓皇溃退，掘开蚀月河坝以阻追兵，将都城周围全部淹没成为沼泽，改称“玄龙之国。”此被称为“黑龙之乱”。龙人之国就此瓦解。
小单于攻天都不克，闻黑龙败，乃劫掠退兵。白龙，赤龙逐之，不及。
神农氏聚合残部，还帝丘，见满目疮痍，激愤成疾，卧床不起，乃以八卦卜问后事。卦得：任黄帝可安天下，任赤帝，必乱天下。赤帝闻之，大怒。
青帝，白帝闻神农氏病笃，乃命人出海入山求访不死药，未果。
南方部族开始强盛。
第二章
神农氏病危，召四帝合议后事，意在黄帝，黄帝以年幼，德薄，无功固辞。赤帝欲自为之，结好青帝，白帝，不顺。四龙会议无果。
神农氏病死，归葬祖龙陵寝，号“地皇神农”，遗命黄帝继位，黄帝终不敢受，带族人回到领地。
赤帝放弃盘龙古城，领兵接管帝丘之都。其族叔不走，赤龙部分裂。
赤帝邀请青白二帝来议事，二帝不应。
白龙筑南塞北塞。
鬼方侵略白龙国，攻北塞不克而还。两国皆求援于青帝，青帝厌倦陆地纷争，率部众退往海外仙山。
九黎征服雨师风伯部落，与刑天，玄龙结为军事同盟，准备攻击龙人。乃使用计谋，派军师欢兜卑词厚礼臣服赤龙，表示愿意臣服。赤帝大喜，受之不疑。
赤帝决定先消灭黄帝部族，以确立威信和霸权，偷袭了黄龙，黄帝部退守凤鸣山。
蚩尤得到灭世之剑，借道玄龙沼泽，打败了古老东夷部落，斩断天梯建木，切断天地联系。
刑天部落庇护角人反抗军，获得血晶石的秘密，开始挖掘。
蚩尤祭出战神旗，会盟三苗和玄龙，分下不死药，分两路讨伐龙人。
白帝长子察觉玄龙，鬼方阴谋，乃卜得“夬”，为水高于天之象。乃求救于赤帝，青帝。
逐鹿之战，赤帝不敌九黎部落，败绩，退守帝丘之都。盘龙城被围。
赤帝求救于黄龙，青龙。
雨师风伯部作法，使大风雨不止。玄龙击溃青龙留在内河协防的水军，趁势蓄图河水，欲将白龙之国灭顶。白龙部撤守天都，冒险在风雨中将天都升起，以避水势，却被雷火劈中，摇摇欲坠。白帝长子阵亡。
精卫请来日魅，驱散云雨，蒸干洪水，地皆龟裂，金石迸流，玄龙族首领黑帝汁光纪被烤焦在旱魃荒野，不死神话破灭。玄龙族惨败，精锐殆尽，残部逃回暗流之城武隧。
赤帝少女精卫漫游东海终于找到青帝，力竭而死。青帝感而出兵，截断蚩尤后路。
黄帝和白帝之子少昊增援帝丘，始以新武器——轩辕兵车出战，克制兽群，蚩尤不克，闻玄龙大败，四龙已集，乃令雨师风伯作法起大雾，谋划退兵。
少昊献指南车，三龙部尾追围九黎龙骨山与图河处，青龙断其归路，四面蹇之。九黎大溃，蚩尤战死，身首分离。残部护其丧而南逃。灭世之剑为黄帝所得，更名为轩辕剑。
日魅徘徊不去，赤地千里。赤帝抱精卫之尸，跪于荒野，以求赎罪。精卫之尸为羽人形，天降火焰之泪，日魅乃去。
第三章
赤龙之国和帝丘之都鏖战之后，成为一片废墟。赤帝命族人迁徙到黄龙之国，与黄龙合并，赤帝放弃帝位，选择自我流放。黄帝加以挽留，不顾。
青帝修筑虹桥，名“阵（陈）天”，加强与内地的联系。
白帝白招矩退隐，其少子穷桑氏嬴挚继位，是为少昊，迎娶青帝次女。开始结好青帝，黄帝，加固城塞，铸造武器，研究科技，强化军法，训练战士，积极备武。
赤帝黄帝部落合并，黄帝劝说赤帝回来共掌族事，其农业和园艺技术得到很大进步，很快繁荣。遂建轩辕之丘，作为新的首都。
黄帝与赤帝共同执掌部落，再开氏族会议，规定由四族人循环担任首脑，避免内乱。
小单于再度南侵。白帝联合黄帝，赤帝，出兵塞外，逐鬼方于沙漠以北。
青帝病危，寻访海外仙药未果，发现了瀛洲。没有见到仙人，却因为帮助侏儒杀死了一些野兽而被当作大神。
黄帝听说九黎和刑天学习黄泉的不死之术，采集血晶石，蚩尤将要复活，决定联合白帝南征以消除后患，赤帝镇守后方。青龙以青帝病危，故不出征。
白龙进入了玄龙之国，却不敢深入泥沼中的暗流之城武隧，只得绕行黄昏之地雷泽。
龙人联军击溃九黎守军，进入蚩尤城，拔下的蚩尤战神旗，破坏了黄泉魔阵，蚩尤转生失败，遗体被残部保护，逃往不死之国。
不死国主刑天率众迎战龙人，黄帝始见血晶石与不死药的威力。混战中以轩辕剑切下了刑天的头颅，取得了惨胜。
黄帝虽然攻克了不死城，会师白龙，却不敢深入地下之国，只得退兵。途中遭到复活的刑天率领肢体不全的不死部众伏击，以魔盾“生之忧戚”将黄帝震伤。
黄帝强支伤体，和众帝登上龙骨山脉，封禅，告祭天地，宣布此次远征的胜利。东夷族遣使来贺，并表示愿意臣服。
青帝灵威仰病逝，龙人四部为其发丧。部族推举颛顼为新首领。颛顼为灵威仰之子。
黄帝旧伤发作，不能理事，遂接受建议，入幻蜃林地修行疗养，从巢居大师赤松子。将帝位依例传给白帝少昊。是为后五帝之始。
